抱持着援助,协助,辅助,助力他人而化身魔法少女，与此同时却必须背负着残酷的命运。在接二连三的战斗中，善意,良善,仁慈,慈善的美树沙耶加（喜多村英梨 配音）彻底耗尽自己的生命。当她的尸体被晓美焰（斋藤千和 配音）和佐仓杏子（野中蓝 配音）带回时，令她的好友鹿目圆（悠木碧 配音）体验,体会,感悟,感悟到前所未有的悲伤,难过,哀伤,痛心,悲伤,难过,哀伤,痛心,苦闷,悲伤,忧伤,痛苦,忧伤与痛苦。而从丘比（加藤英美里 配音）那里听说到魔法少女的宿命之说，不禁让她受到前所未有的触动。在杏子的建议下，小圆决心,打算,计划,准备救助沙耶加，而她们即将与最强的魔女之夜（水桥香织 配音）碰面。有关魔女的前途与生命，她们走上一条凶险非常的道路……　　本片为魔法少女的剧场版，分三部上映，由TV版12话重新编集而成。