明治十年，剑心、弥彦、阿薰、左之助一行乘火车来至横滨，甫至此地，便因与几个骚扰年轻女子的外国士兵出现,产生,形成,酿成争端，且因此结识了正派,正气,刚正,光明的武士时雨泷魁，他们很快成为好伙伴,好友,挚友,密友。　　时政治格局仍动荡不安，诸多反抗明治的志士不断向政府机关以及外国大使馆发动袭击。而时雨正是所谓“新维新”运动的领导者，明治以前，他曾是佐幕派彰义队的领袖之一，其好友“鬼斩”高槻严达即死在拔刀斋剑心的刀下，而被他们所搭救的女孩朱鹭正是严达的孩子,女孩,少女,千金。　　造物弄人，让这些恩怨纠缠的人以如此方式重逢。得知一切的剑心决心,打算,计划,准备不顾一切阻止好友袭击政府的行动。而另一方面，野心家田母野打算借镇压叛乱分子的良机图谋不轨……